Международная команда исследователей выявила особые молекулы РНК, которые помогают определять рак и управлять его развитием. Малая молекула T3p, впервые обнаруженная в тканях рака груди и отсутствующая в здоровых клетках, стала отправной точкой для шестилетнего проекта по систематическому поиску «сиротских» некодирующих РНК (oncRNA) во многих типах рака, пишет ScienceDaily.
Исследователи проанализировали данные более чем 100 тысяч пациентов, используя базы данных The Cancer Genome Atlas, и выявили около 260 тысяч раково-специфических малых РНК. Они обнаружили, что каждая опухоль имеет уникальный «отпечаток» этих молекул, который позволяет с высокой точностью определять тип рака и даже его подтип. Машинное обучение позволило классифицировать опухоли с точностью до 90,9%, а при проверке на другой группе пациентов точность сохранялась на уровне 82,1%.
Некоторые из этих молекул не просто маркеры, но и активные участники опухолевого роста. Эксперименты на мышах показали, что около 5% oncRNA стимулируют прогрессирование опухоли. Две молекулы из рака груди ускоряли метастазирование и деление клеток, что повторялось и в данных пациентов.
Особое внимание ученых привлек тот факт, что опухолевые клетки активно выбрасывают эти молекулы в кровь. Измерение количества oncRNA в сыворотке пациентов показало, что высокие остаточные уровни после химиотерапии связаны почти с четырехкратным снижением выживаемости. Это открывает возможность мониторинга минимальной остаточной болезни и раннего выявления рецидивов с помощью анализа крови, что сложно делать при традиционном мониторинге через клеточную ДНК.
Исследователи уже работают над клиническими приложениями открытых данных: совместно с биотехнологической компанией Exai Bio разрабатываются тесты на основе oncRNA для диагностики и классификации рака. Открытый доступ к результатам позволит ускорить исследования и открыть новые горизонты в онкологии.